Komora magistara farmacije FBiH je zakonom utemeljeno strukovno udruženje koje kontinuirano radi na osposobljavanju farmaceuta i stvaranju mogućnosti za odgovorno i kompetentno obavljanje djelatnosti farmaceuta kao zdravstvenog profesionalca u pacijentu-orijentiranoj zdravstvenoj njezi.
Komora se diferencirala kao respektabilna i internacionalno prepoznatljiva organizacija kroz svoje aktivnosti koje su usmjerene na:
- unaprijeđenje i optimizaciju uloge farmaceuta kao člana zdravstvenog tima, - stvaranje mogućnosti i poticanje farmaceuta na kontinuirani profesionalni razvoj, - pružanje informacija o novostima relevantnim za farmaceutsku djelatnost, - unaprijeđenje suradnje sa zdravstvenim institucijama i podizanje svijesti cjelokupnog društva o ulogama farmaceuta esencijalnim za očuvanje i unaprijeđenje zdravlja stanovništva, - omogućavanje bolje suradnje među svojim članovima kao i internacionalnu suradnju sa kolegama.
Aktivnostima, kao što su harmonizacija zakonskih propisa, aktivno učestvovanje svih članova Komore u projektima na kojima se radi, saradnjom sa svim zdravstvenim institucijama se postiže profesionalni razvoj farmaceutske struke, a u svemu tome educiran magistar farmacije može odgovoriti zahtjevima savremenih trendova farmaceutske njege i novih zahtjeva sistema zdravstvene zaštite.